О предоставлении отдельной квартиры инвалиду из перечня тяжелых форм заболеваний

1. Заболевание нашей дочери входит в перечень заболеваний, дающих инвалидам, страдающим ими, право на дополнительную жилую площадь, утвержденный Приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации от 30 ноября 2012 г. № 991н.
2. 22.11.2017 г. у дочери не приняли заявление на предоставление квартиры в соответствии с Постановлением Правительства РФ от 16.06.2006 № 378, заставив взамен этого написать заявление на предоставление квартиры как малоимущим (хотя это не подходит нам). Естественно, в феврале 2017 г. получили отказ.
3. После нашего обращения в приемную Президента РФ по Омской области в марте 2017 г. из Администрации г. Омска пришел ответ, суть которого сводится к тому, что с 01.01.2018 Постановление № 378 отменено и ни на что рассчитывать мы не можем.
4. Мой вопрос: Постановление Правительства РФ от 16.06.2006 №378 с 01.01.2018 утратило силу. В комментариях пишут, что нужно руководствоваться Приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации от 30 ноября 2012 г. № 991н. А обязателен ли этот приказ к исполнению органами местного самоуправления? На основании каких НПА? Заранее спасибо за ответ!