Правомерно ли заказчик выставил требование об уплате штрафа исполнителю?

Здравствуйте! В ходе приемки работ заказчиком было установлено, что работы выполнены не в полном объеме, о чем в адрес исполнителя была направлена претензия, в которой дан срок для довыполнения работ, а также выставлен штраф за неисполнение исполнителем своих обязательств в полном объеме. И поскольку работы, указанные в претензии, исполнитель будет выполнять уже после установленного контрактом срока окончания работ, то в дальнейшем исполнителю будет еще выставлена пеня за каждый день просрочки исполнения обязательств. Исполнитель считает, что штраф неправомерен, поскольку ему уже выставлена пеня за просрочку. Прав ли исполнитель? Или заказчик прав? Факт неисполнения исполнителем обязательств по контракту был же.