Заключение Доп соглашения по аренде

Новый руководитель имеет право действовать от имени организации без доверенности, поэтому вправе подавать документы на регистрацию в Росреестр. Кроме того, исходя из сложившейся судебной практики даже отсутствие государственной регистрации обязывает все стороны договора, дополнительного соглашения в случае его подписания выполнять его условия и без его регистрации

Не должно быть никаких проблем. Тот факт, что новый руководитель не знал о существовании доп. соглашения, не делает само доп. соглашение недействительным.

К тому же, нет согласия собственника здания (это город) на увеличение площади аренды...

Что ж вы сразу об этом не указали. А в договоре есть ссылка на то, что подобные действия (изменение площади) производятся с согласия собственника?

Хм. Интересный расклад. Понятно. Подписать подписали, реально пользовались, а нигде этого зафиксировано не было.

Хочу вселить в вас надежду.

Хоть Росреестр и не очень смотрит на даты, но это доп. соглашение, а не договор. И дата годичной давности. И оно сильно изменяет договор. На этом основании да, могут и отказать. Других поводов не вижу.

Ах, да. Еще доверенность - будут не совпадать фамилии в допе и доверенности.

Так что, есть еще уверенность, что откажут. 

Других оснований нет

еще какая проблема есть. Росреестр сразу же передает всю инфу в налоговую. Если зарегят, то инфа уйдет в ФНС А это значит налоги, то да сё. Так что...нет смысла регистрировать