Не могу получить свой товар, так как не являюсь грузополучателем, хотя оплатила всю стоимость товара.

К сожалению, у транспортной компании вы даже в судебном порядке двигатель не сможете истребовать. Требовать исполнения обязательства по передаче вам двигателя необходимо у продавца. Тот факт, что продавец исчез, не лишает вас права обратиться в суд, только бы продавец не успел ликвидироваться или начать процедуру банкротства. Если двигатель вы заказывали для своего личного автомобиля, то обращаться в суд можно у нас в Уфе, т.к. это потребительские правоотношения, а иски о защите прав потребителей могут предъявляться по месту нахождения истца. Одновременно с подачей иска необходимо будет обратиться с ходатайством о применении мер обеспечения иска - запрета ТК каким-либо образом распоряжаться  двигателем, т.е. судом будет выдан исполнительный лист, на основании которого судебный пристав опишет двигатель и передаст его на ответственное хранение ТК.