Хочу прописать племянника, квартира оформлена на маму, но у меня генеральная доверенность.

Добрый день регистрация по месту жительства производится только с согласия собственника. По доверенности зарегистрировать кого-либо нельзя. Кроме того если ваш племянник не достиг 14 лет, то зарегистрировать его возможно только с одним из его родителей опять же по собственноручно написаному заявлению собственника.