Могу ли я оформить договор аренды части своего жилого помещения под офис с ООО (микропредприятие), единоличным собственником которого сам и являюсь?

Здравствуте! Вы это можете сделать, это не запрещено нормами законодательства россии, но во избежания проблем с налоговым органом и доначисления налогов цена аренды должна быть рыночная и не завышена. Лучше, чтобы она подтверждалась отчётом оценщика 

Здравствуйте!

Нет, не можете.
Согласно ст. 671 Гражданского кодекса Российской Федерации по договору найма жилого помещения одна сторона - собственник жилого помещения или управомоченное им лицо (наймодатель) - обязуется предоставить другой стороне (нанимателю) жилое помещение за плату во владение и пользование для проживания в нем.

Юридическим лицам жилое помещение может быть предоставлено во владение и (или) пользование на основе договора аренды или иного договора. Юридическое лицо может использовать жилое помещение только для проживания граждан.

Кроме того, согласно п. 3 ст. 288 ГК РФ размещение собственником в принадлежащем ему жилом помещении предприятий, учреждений, организаций допускается только после перевода такого помещения в нежилое. Перевод помещений из жилых в нежилые производится в порядке, определяемом жилищным законодательством.

Таким образом, с формальной точки зрения предоставление жилых помещений в аренду под офисы противоречит законодательству.   

С Уважением!

Александр, проблема  не только в том, о чём вам написал коллега Трубинов Д.В., но и в том, что это мнимая сделка, и ФНС вправе будет оспорить её в суде.