Может ли муж выписать жену и ребенка из квартиры где они прописаны,если собственником является его отец?

Добрый день.

Только собственник жилья вправе требовать выселения. В данном случае хозяином квартиры является свекр, вот он и может требовать вашего с сыном выселения, как собственник.

ст. 35 ЖК 

В случае прекращения у гражданина права пользования жилым помещением по основаниям, предусмотренным настоящим Кодексом, другими федеральными законами, договором, или на основании решения суда данный гражданин обязан освободить соответствующее жилое помещение (прекратить пользоваться им). Если данный гражданин в срок, установленный собственником соответствующего жилого помещения, не освобождает указанное жилое помещение, он подлежит выселению по требованию собственника на основании решения суда.